Padecía mesotelioma pleural, un tipo de cáncer que afectó sus pulmones y que ya había enfrentado en ocasiones anteriores. Su decisión de retirarse definitivamente de la alcaldía, anunciada el 15 de septiembre, fue descrita por él mismo como un acto de responsabilidad ante la imposibilidad de continuar con sus funciones. La noticia de su muerte provocó una ola de condolencias, encabezadas por el gobernador Samuel García, quien lo calificó como "un grande del estado" y aseguró que "Nuevo León es lo que es gracias a la grandeza y el coraje de su gente". El municipio de San Pedro declaró luto oficial, suspendiendo todos los eventos públicos del 23 al 28 de septiembre y colocando un moño negro en la Presidencia Municipal. La comunidad respondió con muestras de afecto, montando una ofrenda con flores y mensajes en el Museo La Milarca, recinto que alberga gran parte de su vasta colección de arte y piezas históricas.

Fernández Garza deja un legado imborrable, habiendo gobernado San Pedro en cuatro ocasiones (1989-1991, 2009-2012, 2015-2018 y 2024-2025).

Su trayectoria abarcó también el Senado de la República y una candidatura a la gubernatura en 2003, además de ser consejero en importantes corporaciones como Alfa y BBVA Bancomer. Su figura, plasmada en documentales y popularizada en redes sociales, es recordada por su estilo directo y su profundo impacto en la política, la cultura y el desarrollo de uno de los municipios más ricos de Latinoamérica.