Su muerte ha generado pesar en la comunidad católica de la región, y se han organizado honras fúnebres en Rosarito, Tecate y Tijuana, donde sus restos serán sepultados en la Catedral. La Arquidiócesis de Tijuana y la Conferencia del Episcopado Mexicano confirmaron el deceso de Monseñor Francisco Moreno Barrón, ocurrido el domingo 26 de octubre a las 03:26 horas en el Hospital Simsa de Tijuana. El arzobispo padecía cáncer desde 2023, enfermedad que lo había mantenido delicado de salud y alejado de algunas ceremonias públicas en los últimos meses. Nombrado por el Papa Francisco en 2016 para suceder a Rafael Romo Muñoz, Moreno Barrón lideró la arquidiócesis durante ocho años, destacándose por su trabajo en favor de los migrantes y su llamado a la paz. Las honras fúnebres comenzaron el martes 28 de octubre en Playas de Rosarito, continuaron el miércoles en Tecate y culminarán el jueves 30 de octubre en Tijuana. Sus restos serán velados en la Catedral de Santa María de Guadalupe, en la Zona Río, de las 12:00 a las 18:00 horas, para después ser sepultado en la Capilla de Cristo Resucitado, dentro de la misma catedral.

Fieles católicos han acudido a despedirlo, expresando su tristeza y reconociendo su legado.

“Muy triste por la pérdida de nuestro señor obispo... perdimos a un gran sacerdote”, manifestó una feligresa llamada Rosa Icela, quien aseguró que Moreno Barrón deja un gran legado de perseverancia, fortaleza y fe.